Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms