Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MEPEQ9NQ76 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms