Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms