Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms