Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EDEM3Q9BZQ6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms