Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms