Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms