Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms