Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD9AQ99638 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms