Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms