Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms