Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC74BQ96LY2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms