Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms