Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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LRRC39Q96DD0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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LRRC39Q96DD0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC39Q96DD0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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