Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms