Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX21Q969T3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX21Q969T3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms