Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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C11orf40Q8WZ69 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf40Q8WZ69 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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