Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APH1BQ8WW43 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms