Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms