Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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