Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms