Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPC24Q8NBT2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms