Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms