Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD163Q86VB7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms