Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms