Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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