Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms