Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms