Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms