Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms