Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms