Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms