Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q499Y3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q499Y3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q499Y3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q499Y3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q499Y3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q499Y3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q499Y3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q499Y3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q499Y3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q499Y3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q499Y3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms