Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
QSER1Q2KHR3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms