Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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