Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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FOXD1Q16676 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
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