Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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