Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK5Q16478 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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