Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS72Q15906 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms