Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms