Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms