Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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COL4A6Q14031 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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COL4A6Q14031 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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