Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CCINQ13939 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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