Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC16Q13042 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms