Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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