Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
STX4Q12846 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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