Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROQ12816 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROQ12816 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROQ12816 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROQ12816 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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