Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms