Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms