Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms